Pencapaian AI Terobosan Google DeepMind untuk Struktur Protein Kini Dapat Memodelkan DNA

Google menghabiskan sebagian besar tahun lalu untuk membangun chatbot Gemini-nya untuk melawan ChatGPT, memasarkannya sebagai asisten AI multifungsi yang dapat membantu dengan tugas-tugas kerja atau pekerjaan digital dari kehidupan pribadi. Secara lebih diam-diam, perusahaan telah bekerja untuk meningkatkan alat kecerdasan buatan yang lebih spesifik yang sudah menjadi keharusan bagi beberapa ilmuwan.

AlphaFold, perangkat lunak yang dikembangkan oleh unit AI Google DeepMind untuk memprediksi struktur 3D protein, telah menerima upgrade signifikan. Sekarang dapat memodelkan molekul lain yang penting secara biologis, termasuk DNA, dan interaksi antara antibodi yang dihasilkan oleh sistem kekebalan tubuh dan molekul organisme penyakit. DeepMind menambahkan kemampuan baru tersebut ke AlphaFold 3 sebagian melalui teknik pinjaman dari pembuat gambar AI.

“Ini adalah kemajuan besar bagi kami,” Demis Hassabis, CEO Google DeepMind, mengatakan kepada WIRED sebelum publikasi paper AlphaFold 3 di jurnal sains Nature. “Ini persis apa yang Anda butuhkan untuk penemuan obat: Anda perlu melihat bagaimana molekul kecil akan terikat pada obat, seberapa kuat, dan juga apa lagi yang mungkin terikat padanya.”

AlphaFold 3 dapat memodelkan molekul besar seperti DNA dan RNA, yang membawa kode genetik, tetapi juga entitas yang jauh lebih kecil, termasuk ion logam. Perusahaan Google mengklaim bahwa perangkat lunak ini dapat memprediksi dengan akurasi tinggi bagaimana molekul-molekul berbeda ini akan berinteraksi satu sama lain.

Perangkat lunak ini dikembangkan oleh Google DeepMind dan Isomorphic labs, sebuah perusahaan saudara di bawah induk Alphabet yang bekerja pada AI untuk bioteknologi yang juga dipimpin oleh Hassabis. Pada bulan Januari, Isomorphic Labs mengumumkan bahwa mereka akan bekerja dengan Eli Lilly dan Novartis dalam pengembangan obat.

MEMBACA  SpaceX's Polaris Dawn menyelesaikan spacewalk swasta pertama

AlphaFold 3 akan tersedia melalui cloud untuk peneliti luar mengakses secara gratis, tetapi DeepMind tidak merilis perangkat lunak sebagai open source seperti yang dilakukan untuk versi sebelumnya dari AlphaFold. John Jumper, yang memimpin tim Google DeepMind yang bekerja pada perangkat lunak, mengatakan bahwa ini dapat membantu memberikan pemahaman yang lebih dalam tentang bagaimana protein berinteraksi dan bekerja dengan DNA di dalam tubuh. “Bagaimana protein merespons kerusakan DNA; bagaimana mereka menemukannya, memperbaikinya?” Jumper mengatakan. “Kita bisa mulai menjawab pertanyaan-pertanyaan ini.”

Memahami struktur protein dulunya memerlukan kerja keras menggunakan mikroskop elektron dan teknik yang disebut kristalografi sinar-x. Beberapa tahun yang lalu, kelompok-kelompok penelitian akademis mulai menguji apakah deep learning, teknik yang ada di hati banyak kemajuan AI baru-baru ini, dapat memprediksi bentuk protein hanya dari asam amino mereka, dengan belajar dari struktur yang telah diverifikasi secara eksperimental.

Pada tahun 2018, Google DeepMind mengungkap bahwa mereka sedang mengerjakan perangkat lunak AI bernama AlphaFold untuk memprediksi dengan akurat bentuk protein. Pada tahun 2020, AlphaFold 2 menghasilkan hasil yang cukup akurat untuk menimbulkan kegembiraan dalam biologi molekuler. Setahun kemudian, perusahaan merilis versi open source dari AlphaFold untuk siapa pun yang ingin menggunakannya, bersama dengan 350.000 struktur protein yang diprediksi, termasuk hampir setiap protein yang diketahui ada di tubuh manusia. Pada tahun 2022 perusahaan merilis lebih dari 2 juta struktur protein.